想到杜预一语成谶，卫瓘人生最终未得善终。平蜀归来，朝廷准备对卫瓘进行封赏。但卫瓘认为“克蜀之功，群帅之力，二将跋扈，自取灭亡，虽运智谋，而无搴旗之效”，因此坚辞不受。265年司马炎建立晋朝后，卫瓘先后担任征东大将军、征北大将军，镇守青州、并州等地。278年卫瓘入朝担任尚书令、侍中、司空等宰相级别的高官，他“为政清简，甚得朝野声誉”。

卫瓘对晋朝可以说是忠心耿耿，他见司马炎的儿子、太子司马衷痴傻，不能理政，屡次想上奏废除太子，另立储君，但都没有机会。

后来司马炎在陵云台大宴文武，卫瓘假装喝醉了，跪在武帝御座前说道：“臣欲有所启。”

司马炎说道：“公所言何耶？”

卫瓘卫瓘再三欲言又止，只好用手抚床说道：“此座可惜！”

司马炎何其聪明，马上领悟了，说道：“公真大醉耶？”此后卫瓘再也没提及此事。卫瓘的行为得罪了太子妃贾南风，贾南风因此对卫瓘怀恨在心。

插一句，其实最初司马炎准备给太子娶卫