逃至徐州转进淮安后，由原总督京营太监卢九德联系上江北四镇高杰、黄得功、刘良佐等部，许以高官厚禄，使得高杰等四镇官员拥立福王为留都南京监国。

马士英、史可法原来是反对福王监国的，史可法给马士英的信这样写道：“福王昏庸糊涂，荒淫无度，不可为监国。”但马士英得知江北诸镇密谋拥立朱由崧后，遂领兵至淮安迎接朱由崧。他是凤阳总督，江北诸镇皆归他节制。马士英老于官场，拥立首功不能旁落他人。

马士英遂向朱由崧表明心迹，带领大军杀气腾腾护送朱由崧来到南京。此刻已不容南京官员反对不同意了。

马士英道：“史公，城外简陋，我等这就迎福王进城再议。”

“不可，马爱卿，闯贼祸乱，本王南逃，宫巻不死即散，只落得孤身一人来到南京，待本王收拾心态，重整仪容，明日再进城，如何？”

史可法抢声道：“福王说的是。待臣命司礼太监卢九德准备一切宫廷器具、使唤宫女太监上船伺候福王，明日一切妥当之后，南京百官及百姓迎福王入城。”

群臣均无异议。

太监卢九德使唤宫女太监，将王宫使用之物搬上龙舟，有：王袍王冠、蜡烛灯台、金银器具、果品点心等一应俱全。福王仍未登基，因此一切均按王公之位礼遇。

福王回到龙舟之上。