朱载坖说道：“东南欠粮，己经成为顽疾，如不痛加惩治，恐日后贻害子孙，朕不能做此错事，当遣方面之臣，坐镇南京，督州县，从严征缴，不使朝廷之税粮流失。”

阁臣们本以为朱载坖会选择和嘉靖一样的处理方式，毕竟派出御史还是能够收回部分欠粮的，但是朱载坖没有选择这种方式，而是选择了要加强朝廷对于东南的控制，朱载坖很清楚，不管是税粮也罢，开海取税也罢，都需要朝廷对于东南的严密控制，否则的话即便是开海，朱载坖也不能收取到朝野所急需的税银。

为了加强对东南的控制，朱载坖认为，要遣阁老重臣，持节假节钺督师南京，将东南钱粮、防务，操于一手，专阃东南，对于敢于抗税的地方豪强，严厉治罪，朱载坖对阁臣们说道：“这些敢于欠粮的地主，己经不是一般的地主了，不怕官府的地主，不能再犹豫了，必须要出重拳！”

而徐阶则是不同意这样的行为，这样的行为无疑会激化朱载坖和朝廷与东南士绅的矛盾，这是徐阶不愿意看到的。